剧情概要
第一部
七耀历 1204 年春，托尔茲军官学院诞生了一个全新的班级特科班《七班》，其成员是和最先进的战术导力器 ARCUS 有着高契合度的 9 个学生。刚入学他们就碰上了一场实战考验。在协力通过考验后，全员怀着自己的抱负表示留下。
黎恩·舒华泽 地方贵族之子
亚莉莎·莱恩福尔特 帝国最大重工企业的大小姐
艾略特·克雷格 想成为音乐家的正太
劳拉·S·亚尔赛德 武术名门之女
马奇亚斯·雷格尼兹 帝都首长儿子
艾玛·米尔斯汀 入学成绩位居榜首的七班班长
尤西斯·艾尔巴雷亚 名门贵族《四大名门》的次子
菲·克劳赛尔 猫系少女
盖乌斯·沃泽尔 高大的留学生
莎拉·巴雷斯坦 级任教官
学院生活由好几个模式组成。
- 平时上课部分跳过，但是有时会有放学后的要素收集
- 实习前有一个“自由活动日”，也就是一个星期天。三好学生黎爷会在这一天里帮学生会跑腿解决委托，刷同学好感和探索旧校舍。
- 重头戏就是每月都会安排的名叫《特别实习》 的企划，将七班成员分为 A、B 两组分别前往帝国各地进行实习。玩家只能操作黎爷所在的 A 组。
三月第一次到凯尔迪克，那里有个远近闻名的大市集。实习过程中大市集发生了不明盗窃事件，七班为了解决它开始调查，并最终在露纳利亚自然公园里找到了失窃的物资。然而这时他们却被赶来的当地领邦军包围。随后克蕾雅上尉带领铁路宪兵队（简称 TMP）前来救场，最后结束实习返回。
四月第二次实习在尤西斯老家，贵族都市巴利亚哈特。实习中发现领邦军在不断扩军，他们感受到贵族和改革派的对立在不断升级。中途尤西斯被老家召回离队，接着马奇亚斯因首相儿子身份被逮捕（这一操作我就完全看不懂，绑了他对领邦军也没好处）。在游击士托瓦尔的帮助下黎爷一行潜入地下水道，并在半路和出逃的尤西斯会合。菲凭借猎兵出身习得的技能打通了地下牢房的路，救出马奇亚斯。得手后七班被领邦军放出的军用猎犬追击，追退狗子后又被领邦军追上包围。随后莎拉和尤西斯哥哥盧法斯出现收拾局面。最后结束实习。
期中考。这些要素和女神异闻录 5 有不少相似的味道。
第三次实习前往盖乌斯故乡，地处帝国东北边境的诺尔德高原。七班在大草原上策马奔腾好不快活——还遇到了亚莉莎外公，莱恩福尔特前会长。第二天，在帝国边境用于监视共和国的帝国军监视塔受到炮击，然后两国的关系就紧张起来了。七班开始独自搜索犯人，途中遇到白兔米莉亚姆·奥莱恩，并从她那知道了犯人行踪。七班和白兔合作捉到了犯人，但是头目《G》逃脱了。（合着精锐装甲师团调查不出这点原因，乖乖被利用？反而被几个学生推测出了炮击地点找到线索）。后来和白兔同为情报局的雷克多上尉出面和共和国交涉，避免了军事冲突。实习结束返回。
插播一节菲和劳拉关系恶化，为后面和解铺垫；还有黎爷妹妹爱丽榭来访，中途被瑟蕾奴引导至旧校舍触发了机关，黎爷为保护妹妹爆发鬼之力。
第四次实习在七月仲夏节期间的帝都海姆达尔进行。七班解决了结社怪盗 B 引发的一些骚动，随后收到莎拉的消息，受皇子皇女邀请共进晚餐。大家向皇子了解设立七班的内情，除 ARCUS 外，他们也是用于消除各种对立的试金石，另外七班的活动也受几个不同派系的理事影响（就是找了各个派系的公子小姐们吧）。随后七班接到克蕾雅消息，希望他们帮忙警戒准备在仲夏节首日造次的恐怖分子们（这就是碍于理事的面子给主角们派点边边角角的活）。第二天七班巡逻并处理异变，逮住了帝国解放战线的《G》，但不敌随后增援的首领《C》，铁路宪兵队将赶到时他们就撤退，当然公主也救回了。结束实习。
学分不足的学长克洛·安布斯特，还有白兔米莉亚姆加入七班。第五次实习在劳拉故乡雷格拉姆，并且实习后要和 B 组会合一同前往加雷利亚要塞。实习中劳拉老爹和托瓦尔察觉到贵族派的危险动向而离开，七班则继续实习。当晚他们出发去古城解救被困的小孩。艾玛展现出她的魔女之力，最后他们面对强大的 boss 时，还有神秘甲胄出手相助。在中转站和 B 组会合，还看到去克洛斯贝尔参加通商会议的宰相皇子和托娃所在的列车，黎爷展现出不凡的动态视力。在加雷利亚要塞见到了帝国最强的第四装甲师团和列车炮，还有艾略特的爸爸克雷格中将。第二天收到了克洛斯贝尔遭袭的消息，而要塞内部也发生了无人战车失控的情况。同时《帝国解放战线》也前来偷袭（这么点个人来偷袭最大的军事要塞？）试图启动列车炮炮击莲花塔。这时候七班当仁不让，协助莎拉和奈特哈尔教官兵分两路压制两门列车炮。成功阻止了发射，但是《S》和《V》 还是溜走了，未出面的《C》预告了下次行动后扬长而去。
虽然出了要塞这个意外状况，托尔茲的理事们最终还是决定继续《特别实习》。同时七班也开始为下个月的学院祭做准备。实习的出发日，飞行巡洋舰《卡雷贾斯》亮相，并送他们到了亚莉莎老家所在的盧雷。亚莉莎妈妈伊琳娜会长给七班出了课题。期间领邦军和 TMP 在街上起冲突，然后各自的头头克蕾雅和盧法斯互相较劲。中途也穿插亚莉莎的家务事。随后克蕾雅联络黎爷送上了情报，说 RF 内部对立也很严重，TMP 会进行强制调查。第二天市内军需工厂发生火灾，札克森铁矿山也被恐怖分子占领。然后领邦军则以对付恐怖分子为借口封了矿山，目的是为了阻止 TMP 介入。克洛和安洁莉卡·罗格纳还有乔治来到盧雷给七班助阵。七班穿过地下通道前往矿山。中途克洛离队护送受伤矿工，七班和《V》搏斗，正要拿下一局时《C》出现了。两人乘着飞行艇准备跑路，飞行艇却被某人的黑枪打爆。随后奥利巴特皇子出面平了造次的领邦军并安排调查。
（广播剧CD 幕间）七班九月的矿山行动受到皇帝赏识，见到了四大名门头头等高层，又被皇帝招待了温泉乡小旅行——就是黎爷的故乡悠米尔。同时大家也在准备学院祭。学姐安洁莉娜因父女吵架而休学。里面还点到了黎爷摆脱了迷茫，解决冰雪异变。黎父在和黎爷道别时把云老师让他保管的《八叶》中传卷轴给了黎爷。
10 月 23 学院祭，期间聊天各种游戏要素收集，第一天晚上旧校舍异变，等七班穿过结界在艾玛瑟蕾奴的带领下打通后出现在他们面前的是巨大的灰之骑神。第二天学院祭剧情，后夜祭向克洛要 50 米拉的利息。
托娃上次的学院祭
然后突如其来的消息，受到来自克洛斯贝尔的攻击，加雷利亚要塞被消灭了。第二天宰相发表宣战演说，七班通过深渊魔女薇塔·克洛提德的术式观看到现场直播。演说即将到高潮时《C》也就是克洛开枪狙击了宰相。与此同时贵族势力的大量机甲兵投入整个帝都，蹂躏了主力战车。薇塔振声宣布：奥菲斯最终计划第二幕，幻焰计划，开始“第二乐章”。
机甲兵马上就要逼近托利斯塔了，七班和教官决定奋起反抗。贵族班没理由反抗，平民班没能力反抗，七班自然当仁不让。靠肉身打败机甲兵，面对《S》的队长机黎爷首次召唤了《灰之骑神》瓦利玛战胜了她。随后克洛开着他的《苍之骑神》奥尔迪涅打败了黎爷。留下保护着《灰》的七班同学，瑟蕾奴指挥骑神脱离战场保命，在黎爷的哭喊声中第一作落幕。
第二部
黎爷从老家后院般的《艾辛格特山脉》中醒来，和他一起的是黑猫瑟蕾奴和停止活动了的瓦利玛。原来时间已经过去了一个月多，黎爷听后压抑着心中的不快和懊悔加快脚步下山。中途遭遇了野生魔煌兵，在黎爷因伤就要败下阵来时，托瓦尔带着妹妹公主前来营救，黎爷顺利回到了故乡家里。在了解到同学们各自逃往远方下落不明后，被妹妹鼓励后振作起来的黎爷决定去寻找同伴们。这时又突发意外，有猎兵袭击了悠米尔，黎父重伤倒地，黎爷魔化后制服了猎兵。随后克洛提德现身，对这场艾尔巴雷亚公爵的独断行为致歉，随后撤走了猎兵，这时候黑兔亚尔缇娜从天而降掳走了妹妹和公主。
黎爷出发前往交易镇凯尔迪克，率先和潜伏在那的马奇亚斯、艾略特和菲会合。他们原打算前往有《第四》驻扎的加雷利亚演习场，黎爷就和他们一起。在演习场前遇到了拦路的《西风旅团》所属的杰诺和雷欧，跟他们打了一场后又遇到打算来偷袭演习场的贵族联盟军。黎爷召唤骑神打了一架，但数量不敌对方，紧要关头克雷格中将率领坦克群前来对阵，同时克蕾雅率领的 TMP 也来支援，打退了联盟军和猎兵。随后克雷格邀请他们加入正规军，黎爷几人的目的是寻找同伴，所以没有答应，随后离开演习场前往高原诺尔德。
因《监视塔》被联盟军占领并设置了干扰器所以没法（和村庄）通讯，众人向塞克斯中将处借了马，出发去诺尔德村落。在村落和盖乌斯、亚莉莎、米莉亚姆重逢。黎爷等人便盘算着夺回《监视塔》，拆除通信妨碍装置（为什么军队会对这装置视而不见任由它干扰？离谱。如果装置妨碍不到军队，那联盟军设它干嘛？）。在塔上和怪盗 B 以及黑兔对阵并被怪盗 B 制服，随后亚莉莎家的战斗女仆，同时也是结社《执行者》的雪伦·克鲁格前来救场。破坏装置后，众人出发前往雷格拉姆。
在雷格拉姆，《枪之圣女》桑德罗特的居城《罗恩格林城》又发生了异变。黎爷一行出发和在那里调查的艾玛和劳拉会合，并解决了异变。艾玛坦白自己《魔女眷属》的身份。
最后到尤西斯老家巴利亚哈特。尤西斯诱导众人到飞船中见面，但因自家是联盟军的主力、哥哥是总参谋、况且前不久还发生了袭击悠米尔的事件，所以觉得无颜面对黎爷和七班同伴。黎爷就表示来场一对一的比试，输了就乖乖跟爷走。比完后尤西斯服软，这时观察他们已久的结社《劫炎》马克邦和《神速》杜巴莉出面和七班对战，莎拉适时赶到现场助阵。而这时候艾尔巴雷亚公爵又乱入，打断了两边的战斗。结社和七班各自瞬移离开。
12月10日，齐聚悠米尔的七班开始讨论今后《第三条路》的方针，会议又被不速之客凯恩公爵打断，同行的还有盧法斯、克洛、克洛提德。打了一场教学赛后公爵“邀请”黎爷上船，并以不干涉悠米尔为条件试图劝诱他加入联盟军。
黎爷上贼船后公爵对他表示只要你加入就能尽快结束内战，百姓也少遭难；盧法斯让他思考自己要为什么而战；黎爷又和克洛促膝长谈，听到了克洛的行动理由。随后黎爷开始在船上到处乱窜。凯恩公爵也真是，拐弯抹角给黎爷送情报大礼包。最后黎爷再到贵宾室救公主。公主斥责他不要以解救妹妹为借口违心加入联盟军，要走自己想走的路。黎爷理解了自己的不成熟后学会了利用《鬼之力》强化剑术。带公主逃到甲板上，再打败等候已久的克洛，此时《鬼之力》耗尽，七班和《卡雷贾斯》赶来救场。见战况胶着，贵族联盟军就收手，红翼扬长而去。
在红翼上继续讨论今后方针。七班表示想协助改善帝国《不如意的现状》，阶段性目标就是召集学院学生，并夺回军官学院（现在学院在贵族们手里）。皇子和子爵把船交给七班，自己前往帝国西部。很快安洁莉卡发来联络，说 RF 被属于联盟军的她叔叔占领，七班前往盧雷和学姐会合。学姐因为说服不了自己亲爹脱离联盟军就决定自己解放盧雷。首先是攻略 RF 大楼解救被软禁的伊琳娜会长。然后安洁莉卡和她爹单挑获胜后他爹就松口表示“脱离联盟军不干涉内战”了（？我就放个问号在这）。最后人在要塞的《V》驾着大型机甲来和骑神打了一场，决定葬身在这的《V》最后因机甲爆炸而亡。
前往各地的精灵洞窟获取塞姆利亚石强化骑神武器。
某天从正规军处传来消息，交易镇凯尔迪克大市集失火。纵火的是领主艾尔巴雷亚公爵，理由呢……感觉不太好编，就安个“独断专行”好了。然后七班前往公爵龟缩的堡垒准备入侵和镇压（反正七班众身手了得，镇压一个堡垒不在话下）。在堡垒外还和《S》打了一架，这次黎爷救下了《S》。尤西斯亲手逮捕了公爵，公爵指挥士兵撤退，艾尔巴雷亚家从内战抽手（又一个以少敌多的经典斩首案例）。
与帝国西边战局呼应，失去大量战力的贵族联盟集中兵力到帝都周边，这样等同于放弃其他地区，所以七班不断蚕食他们的地盘，终于摸到了帝都近郊的托利斯塔。打退了镇上的联盟军，七班受到市民们夹道欢迎。固守在学院里的不是别人，正是和七班相爱相杀的贵族班学生，还有贵族学长学姐们。他们表示：我们要看清如何定位贵族的骄傲和矜持，所以向你们七班提出挑战（反正我是看不清）。七班话不多说把同校贵族学生们全打趴，然后藏在教学楼里的学院长和教官们边拍手叫好边从里边出来，然后说“哎呀打得好，打出了新时代年轻人的骄傲和矜持”。然后全校学生其乐融融走上“第三条路”。
红翼接到正规军委托，让他们解放软禁皇族的《卡雷尔离宫》（这种好事自己不抢着干还拱手给七班？不过七班到底不是外人所以没差啦）。所以能看出来内战里什么坏事都是贵族势力，而且还是那几个贵族头头干的（背锅），跟其他人一点关系也没有（正规军表示：是他们先动手的）。七班的第三条路就是干了是本该正规军他们干的事。打完，皇族和妹妹都救出来了。只有赛德利克皇太子被凯恩公爵带走。这时皇城突然突变成煌魔城。
黎爷感应到克洛在煌魔城里，于是七班决定强袭。就算一路遇到执行者、西风旅团大佬，七班还是奋不顾身地上前帮他们热身，然后再接棒给协力者大佬们打正赛，最后终于到达《绯红王座》。听凯恩公畅谈了一番自己支配帝国的野心后，七班和克洛及魔女开打。打完再上骑神打。
随着克洛落败，内战也随之宣告结束。凯恩公失神抓狂，把皇太子强行融到《绯》的核心，唤醒了《绯红终焉魔王》。克洛和魔女合作，让七班和两架骑神杀入大魔王所在的异界。黎爷切下皇太子所在核心，而克洛遭到大魔王贯穿。克洛留下遗言后走了，在他看来大仇已报所以走得比较安详。
凯恩公极尽反派所能准备干掉皇太子，出面收拾他的是悠然上场的盧法斯，并且以对皇族不敬和引发灾难的罪行逮捕凯恩公。此时盧法斯身为《铁血之子》首席的身份这才被公布。同时，本以为已经死透了的宰相也出现在他们面前（不过之前克蕾雅就说过找不到宰相尸体，已经暗示过了）。除了安排卢法斯削弱贵族势力外，宰相还试图 NTR 结社的《幻焰计划》。面对愤怒的黎爷，卢法斯表示：宰相所做也是跟你有关的……宰相看着愕然的黎爷微笑道：“好久不见了，我的儿子”。
插播一段外传：政府结束内战后旋即和平占领了克洛斯贝尔，并应对来自共和国的攻击。黎爷被政府塑造成结束内战的《灰之英雄》，受政府指令参加克州防御战。（期间还救下了被共和国攻击的悠娜和她的弟弟妹妹）。前作零碧主角洛伊德·班宁斯和《银》莉夏·毛为了从帝国手中保护克州机密情报，潜入地下准备删库跑路，遇到了黎爷黑兔二人组。被洛伊德拖住脚步的黎爷未能来得及阻止删库，就叫来骑神把超算给劈了。随后黎爷就交差离开克州回到了学院。
和学长学姐还有同学们联络下感情，黎爷还被托娃小天使抱着痛哭发泄了一番。最后的自由活动日，黎爷发现旧校舍又有异状，遇到克蕾雅公主妹妹一行，与克蕾雅和解。随后全员登场准备攻略迷宫。尽头是个巨大的白影，自称是因煌魔城失控产生的《里》之考验。战胜后同伴们切身体会到这次是《最后》了。很快春天来临，黎爷和选择就读一年的同伴们道别，大家踏上了各自的道路。
第三部
七耀历 1206 年 4 月，黎爷从托尔茲军官学院毕业，黎爷现在已经以终结内战、还有克州战役和北方战役中取得的辉煌战绩而为人所知，《灰色骑士》声名远播。而如今他要前往就职处——地处帝都近郊利弗斯的《托尔茲军官学院·第II分校》担任教官。几个同事分别是 TMP 的米海尔·厄文少校，克州警察出身的兰道夫·奥兰多，还有就是托娃学姐。校长是内战中的联盟军总司令奥蕾莉亚·勒瑰恩，还有担任特别顾问的 G·施密特博士。黎爷所带的班级也是特务科七班，学生是克州警察学校出身的悠娜·克劳福、帝国武术名门范德尔流的次男库尔特·范德尔、还有黑兔亚尔缇娜。他们同样也被安排参加实力测试，地点是建在校内的实验用《艾因赫尔小要塞》。
奥利巴特皇子提供了神秘古代遗物，使得七班可以透过 ARCUS II 随时随地群聊。在首次作战简报上见到了前来解说《特别训练课程》的雷克多少校以及同行的米莉亚姆。同样，这个就是特别实习的翻版，只不过每次都是教官们带领全校学生出动，毕竟总共也才二十来个学生。三、四作的舞台在前作没有涉及的帝国西部。
第一次演习在沙薩兰特州的圣特亚克。首次任务是处理内战中残留在野外的结社制机械魔兽，并碰到了西风旅团的猎兵王路嘉。随后因其他请托进入《伊斯米亚大森林》，黎爷遇到了神秘少女（魔女族的长老）。回到镇上遇到正太艾略特，现在的他已经是一名小有名气的演奏家了。告别艾略特前往纺织市镇帕尔姆，接着又去调查帕尔姆小径，发现了一条封闭的废道。废道前七班被大量傀儡兵器围攻，劳拉现身解围。现在的劳拉已经取得亚尔赛德流真传，以代理师父身份来到帕尔姆。晚上回到演习地，红色星座的《红色战鬼》谢莉和结社铁机队的《神速》逗巴莉两人奇袭分校以示警告，让分校不要介入最近发生的“异常”。菲也赶来助阵。
第二天早上的作战简报中，政府指示分校依靠自身战力独自解决问题，黎爷领会到政府是要让自己来摆平这件事。而内战后这一年半以来，政府会半强制地让老好人黎爷来帮他们处理事件，这就是所谓的“Order”。同时旧七班三人也来帮忙。据托瓦尔情报，结社是为了从宰相手里夺回《幻焰计划》而做的行动。大家开始收集结社《据点》的情报。到《多雷诺尔要塞》和克雷格将军一番交流后，将军给出许可，允许众人进入被封锁的废道调查。废道里坐落的是过去被称为《哈梅尔》的村庄，而它关系到重大的国家机密。来自利贝尔王国的 A 级游击士《重剑》阿加特也和七班会合了。阿加特讲述了 14 年前的屠村惨剧，渴望战功的贵族将校为了制造和利贝尔王国的开战借口，雇佣落魄猎兵袭击村庄，伪装成他国入侵的样子。村庄被落魄猎兵焚烧，居民几乎全灭。最终帝国政府知道了阴谋，以不公布屠杀事件为条件达成和利贝尔停战。
七班到村里献花后对上了谢莉和逗巴莉，双方都有人前来助阵，最后谢莉召出了巨大的《神机永世》TYPE-γ II，黎爷和新七合力打倒神机后，《西风旅团》三人组现身，包括已经丧命的《猎兵王》路嘉·克劳赛尔。猎兵王驾驶紫色骑神把神机拆成废铁后扬长而去，其他人也陆续撤退。第一次演习结束。
五月份第二次演习是在克州。在莲花塔遇到马奇亚斯，他就职于《司法检察院》，并在克州出差。七班随后和提出委托的缇欧·普拉托会面，并护送她到《地下区块F区块》进行故障修复。终端室遭遇魔煌兵，也碰到了同样因公出差的亚莉莎和她家的女仆雪伦。调查湖畔的幻兽，发现《绯红灵智之草》。回程雪伦突然就开始向黎爷自爆自己以《执行者》身份行动时导致亚莉莎父亲弗兰兹·莱恩福尔特丧命的过去。
后面的演习中遇到了结社的《小丑》坎佩尼拉，还有帮助黎爷从鬼化状态恢复的艾玛和瑟蕾奴。傍晚回城时看到 RF 的移动版列车炮。因为当天有皇子等人的视察团来克州，《第 II》被要求参与晚宴的警备，黎爷和新七有机会和贵宾们聊天叙旧，卢法斯还单独向黎爷讲述自己成为《铁血之子》首席的过程。此时结社的马克邦和《小丑》突然来到莲花塔塔顶，两方激战。他们这次行动是为了捕捉《苍之深渊》克洛提德还有一项《实验》，随后叫出《神机永世 β II》，但没打，直接走了（所以他们为什么要这样露脸？生怕深渊不知道吗）。
第二天雷克多送来请托书，要黎爷查出结社的目的并平息克州的混乱。黎爷和旧七三人开始调查能提供大量灵力来支持他们《实验》的地点，再次和缇欧进入地下区块，艾玛和缇欧合作搜索出了地点《星见之塔》。到塔顶再次和马克邦小丑对战。这次来救场的是新七三人，还有妙婕和亚修，他们还带来了装有推进器的机甲兵和瓦利玛。打败神机后克洛提德、带着面具的失忆克洛（被做成不死者复活）现身，马克邦烧熔神机，小丑宣布开始见证《幻焰计划》夺还，随后撤离。克洛提德说着“《终末的童话故事》已经开始”，也离开了。本次演习结束，在列车上大家看到了《特务支援课》成员。
6 月亚修和妙婕转入新七。乔治和爱丽榭来访，乔治推测现在被称为《黑色工房》的就是《地精》，他们在宰相夺取《幻焰计划》中提供了技术支持。这个月去拉马尔州演习。
在海都欧尔迪斯近郊七班遇到猎兵集团，尤西斯和米莉亚姆帮忙击退猎兵，他们分别因《领邦会议》和情报局任务来到海都。新七为了调查猎兵继续前往亚修老家欢乐都市拉克威尔。新七发现紫色猎兵和《尼德霍格》在交战，莎拉和安洁莉卡出现击退包围了七班的《尼德霍格》。莎拉一直在追踪这个形迹可疑的猎兵团，安洁莉卡也是来参加《领邦会议》的。交换情报后发现，目前有结社的《红色星座》，雇主不明的《西风旅团》，还有《尼德霍格》和不明的紫色猎兵四组人马，紫色猎兵其实是《北方猎兵》的脱离组。
第 2 天接到尤西斯联络米莉亚姆失踪，新七调查到《布利欧尼亚岛》，在岛上发现了《阳灵窟》，米莉亚姆也在其中，还有《铁机队》和新的《神机》。和《铁机队》打到一半时结社第七柱《钢之圣女》雅里安洛德现身。黎爷试图挑战圣女，力量失控后被风哥盖乌斯救下。圣女顺势收手走人。七班发现面具克洛也在，但他不发一语也走了。
第 3 天早上被偷的列车炮开始向欧尔迪斯开火，政府又开出请托，黎爷让新七留在演习地以应对可能出现的《神机》，自己和旧七还有其他分校学生、游击士们去应对列车炮。然后发现列车炮是调虎离山，黎爷和旧七新七前往海上要塞开始攻略。《西风》也想挑战圣女，拦在了七班面前，但是分校长前来劝退了猎兵王。奥蕾莉亚勉强战胜了圣女，随后和《神机》骑神战。圣女没有透露《实验》 的目的，并且秀出她的《银》将《神机》拆烂离开。当晚的《领邦会议》中妙婕被推举为下一任凯恩公爵——她是现任公爵的侄女。这次实习结束。
7 月，又是到仲夏节期间的帝都实习。旧七也安排在帝都全员聚首。被要求演习中要警戒共和国特殊部队《海克力士》，另外也告知前来实习的托尔茲两校都要出席后天在皇城的祝贺会。七班巡逻时遇到原托尔茲的历史学教官汤玛斯·雷山德，其真实身份是隶属七耀教会的星杯守护骑士第二位《匣之术士》，同时在追查《黑色史书》谜团。随后七班听到有趣的线索，开始调查帝都地下道。七班发现《绯红灵智之草》，返回时遇到《海克力士》，一直追着他们到地面的《天空墓园》，却发现总校学生早已守株待兔。正巧克洛的墓碑就在《天空墓园》，大家便去凭吊一番。当离开时发现地上掉落着安洁莉卡的饰品，随后发现墓里空空如也。政府适时送来命令要求明天之内逮捕所有《海克力士》成员。
在这之前偷偷去挖坟的安洁莉卡
当晚旧七班重逢，并讨论七班今后如何行动。他们推断出帝国要侵略共和国，而在“柜面下”宰相又与黑色工房合作，试图引发和帝国悠久历史有关的“某种事件”。因此七班想阻止明面上的战争，也准备遏止“柜面下”的灾厄。
第 2 天全员开始扫荡下水道。七班收到协力者们传来的《海克力士》有异常行为的报告，前往灵脉中心点所在的《帝国博物馆》，并来到博物馆下方的《地下坟场》，之前出现过的《魔女眷属》长老《绯色魔女》罗赛莉亚也在场收拾诡异的特工们。罗赛提到这里是《黑暗龙》（黑暗龙是 900 年前因巨硕之力而生成的魔兽）的沉睡处，得到力量获得肉体的龙正将人的灵魂眷属化。随后黎爷和新旧七班进到门内打败黑暗龙。随后地下坟场恢复，黎爷和躲在一旁的齐格飞（克洛）打了一场。
第 3 天政府对解决事件的托尔茲两校进行表彰，黎爷从克雷格将军处了解到宰相 14 年前的一部分过去。当时贵族派将校派猎兵袭击宰相家，自己生母也因此丧生。时年 5 岁的黎爷下落不明，而 3 个月后奥斯本突然回归，并以终结《百日战役》的功绩被提拔为宰相。晚上庆祝会黎爷和皇帝见面，皇帝提到了帝国的《诅咒》，而皇帝持有的《黑色史书》是一本预言书，皇帝照着上面的预言纵容着宰相。
随后黎爷和宰相见面，宰相说到了《幻焰计划》，黎爷询问宰相自己的《鬼之力》以及为什么宰相没死。宰相浮现出温柔的微笑说到，14 年前他已经把心脏移植给了受到心脏受到致命伤的儿子。便没再多说离开了。
回到会场发现亚修不在，当然被瘴气支配，作为棋子的他现在正忙着刺杀皇帝。
有什么事冲我来
政府将刺杀公开为共和国所为，宣布实施《国家总动员法》，发起宣战。黎爷等人溜到《天空墓园》和旧七班会合，前往帝都海姆达尔大教堂。汤玛斯表明了自己的身份，盖乌斯也说出自己现在已经继承了第八位守护骑士，并和罗赛一起向大家讲述帝国 1200 年前的神话。
《焰》和《大地》两个至宝在交锋下融合为《巨硕之存在》——《钢》，然后《焰》和《大地》的眷属们准备了七个容器（骑神），将《钢》封印到容器里。《焰》和《大地》的眷属分别就是《魔女》和《地精》。而 900 年前《地精》在黑暗龙的灾难种失去《圣兽》（因为当时大地圣兽吸收了大部分的污染，然后自我封印），并和《魔女》断绝了交流。他们成为了《黑色工房》试图引导《巨硕黄昏》实现。工房的主人《黑之艾尔贝里希》是亚莉莎爸爸被地精长老支配后的存在。只有他和宰相知道一切真相。此时克洛提德现身告知结社会协助《巨硕黄昏》，在世界终焉中完成《幻焰计划》。
谈到圣女的复活
接着听到远方响起了钟声，《卡雷尔离宫》地下冒出的瘴气让离宫变成了巨大的《黑色星杯》，在现场的还有失去意识的亚尔缇娜（她本来去情报局试图收集情报，结果入虎口了）和下落不明的乔治，还有《黑之艾尔贝里希》也在。伴随着钟声帝都中也出现了幻兽和魔煌兵，大家朝着星杯前进。汤玛斯和罗赛在星杯结界上开了洞，送新旧七班进去。这次没人救场了，大家不断分散战力拖住 boss 们，最后黎爷和新七下到最底层。
引发变异的正是《黑之圣兽》。奥斯本宰相说要利用帝国的诅咒将被分割的《钢》合为一体，然后用什么斗争的原理将人们引导至更高层次。用《终末之剑》杀死受诅咒污染的圣兽就能开启《黄昏》。《剑》指的是人工生命体的最终形态黑兔。星杯外更是传来了卡雷贾斯被炸成碎片的影像（乔治跳反之前在船上装的炸药）。
这时候白兔为了救被黑兽压制的黎爷和黑兔，受了致命伤，并代替黑兔化为《根源虚无之剑》。看到这一幕后鬼化爆发的黎爷提起米莉亚姆把黑兽切成了碎片。克洛这时恢复意识，在场 6 人召出各自骑神压制住失控的《灰》，《黄昏》就此开始。
第四部
星杯异变后两周，新七三人从魔女村落《隐秘村里靄灵》先后醒来。旧七告诉他们逃出之后的来龙去脉，很多人也下落不明，悠娜鼓励大家振作起来展开行动。妙婕则和奥蕾莉亚将军、《深渊》一起成立了决起军准备对抗帝国。
新七开始在魔女村落的《桑格瑞尔迷宫》锻炼，旧七则先行出发寻找线索。几天后，根据旧七调查以及罗赛的灵视，他们总结出帝国境内出现灵力异常的《特异点》，通过将罗赛提供的特殊的《楔子》打入特异点，也许就能找到《黑色工房》的根据地，而黎爷很可能就被关在那里。新七首先前往的是沙薩兰特州。中途和分校部分同学会合，找到悠娜的机甲兵。找分校学生的途中意外和待在哈梅尔废村颓废的亚修会合。在村口七班遇到结社的《强化猎兵》，还有《西风》的几个大佬。大佬邀请亚修入伙不成就开始和七班战斗，随后艾略特、菲、莎拉前来支援。猎兵撤退。灵摆对特异点产生反应，七班打入楔子后返回魔女村落。
休息一天后新七再次通过转移石出发，这次前往拉玛尔州，同样也是一路找分校学生同时跟着灵摆指示前进。一路走到了皇子老家所在的《阿尔斯塔》，在镇上打听到灵智之草的消息，同时发现了疑似妙婕留给七班的纸条，于是他们前往城镇北边的《欧士基里亚斯盆地》。盆地最深处长满了红黑色的灵智之草，妙婕和奥蕾莉亚也在那。妙婕讲述了自己的出身、经历，同时也说了自己接下来要做的事。面对这样的她，悠娜祭出了王牌：“不是下任凯恩公爵，而是第二分校的妙婕想怎么做？”
正当唬住妙婕时，赛德利克皇太子带着总校一班还有谢莉和米海尔少校突然现身，七班上前迎击。后来旧七班赶来支援，又有帕坦古艾号到来，皇太子等人就撤退了。随后打入楔子法具，妙婕也决定回归七班，将决起军托付给了奥蕾莉亚将军，大家回到靄灵。
新旧七班分头行动，已有五个特异点打入了楔子，而剩下两个也已查明，分别是帝都地下和克州。悠娜想去克州，所以就这样分配下来了。亚莉莎联系了开货运公司的朋友乔丝特，她开来了她的飞船《山猫号II》，带大家飞往克州。到达后开始在市内打听到了灵智之草的目击情报。大家还到医院看望了正在住院的尤根特皇帝，了解到《诅咒》和《黑色史书》的事，皇帝还鼓舞了亚修。七班前往湿地中的特异点，然而《小丑》坎佩尼拉、雷克多和雪伦已恭候多时。最后卢法斯驾驶《金之骑神》现身，七班陷入苦战。随后在艾丝蒂尔、约书亚、洛伊德和艾莉的协助下解围，卢法斯等人撤退。七班打入楔子，向众人感谢并道别后，带着蕾恩和琪雅一起通过精灵之道回到靄灵。
剧情后期才完成解读的最后一本黑色史书
七个特异点已经找齐，罗赛和蕾恩琪雅合力解析出了坐标，显示在拉玛尔州的《葛雷彭山脉》地底。在村里魔女们的协助下，新旧七班由精灵之道前往工房。新七找到被诅咒控制的黎爷，经由 ARCUS II 的连结，黎爷恢复了自我。随后黎爷很快就进入状态并带领大家迎战奥斯本、《黑之艾尔贝里希》、钢之圣女等人，最后又在奥蕾莉亚、克洛提德、乔丝特和汤玛斯的协助下全身而退，还躲过了地方的增援（这一战反派一堆人颜面全无，脸都被打肿了），另外克洛和逗巴莉也脱离工房，一起跑了出来。
为了了解《相剋》，克洛让七班来《阳灵窟》。黎爷和克洛僵持不下，《灰》和《苍》在灵窟内激烈搏斗。黎爷在《相剋》中取得胜利，《灰》开始吸收《苍》的力量，黎爷为了留下克洛，将力量返还给《苍》，并将克洛以眷属身份连结，在《黄昏》结束前可保身为《不死者》的克洛性命无虞（看吧，这就叫有情人终成眷属）。
七班为了打听剩下托娃、皇女等其他的人的情报，同时为了探索第三条路开始重新活动。首先前往海都欧尔迪斯，搭乘盖乌斯的专用飞行艇《梅尔卡巴》出发。七班打听到软禁在城中的是托娃和普利希拉王妃，在克洛的带领下从地下水道侵入城馆。打败了被面具支配的安洁莉卡和克蕾雅，克蕾雅放弃地跑路了。王妃决定继续留在城馆，众人离开。
从安洁莉卡口中得知乔治的近况，众人开始在帝国西部巡逻，希望能救他回来。又接到托娃联络，在圣特亚克得到托尔茲相关人士和皇族的目击情报。艾略特提议举行即时演奏会，从而让正无所事事的巴勒德侯爵主动邀他们入馆。随后问出情况媞妲和艾尔芬皇女在《第四》所在的《多雷诺尔要塞》。攻略要塞，战胜克雷格将军和奈特哈尔中校。七班接受立场不同的《第四》的想法，带媞妲和皇女离开要塞。
又从托娃口中得到利弗斯的情报，施密特博士、爱丽榭和缇欧在第二分校。博士让七班来攻略最后的小要塞迷宫，随后放了两人。
帝国西部巡逻的差不多了，大家准备和东部的艾丝蒂尔等人联络，因为警戒网难以突破，便决定在帝国、共和国、利贝尔三国国界上空会合。在帕坦古艾号上七班表明“想找《第三条路》”，艾丝蒂尔和洛伊德表示也有同样想法。而后结社的航母来袭，大家分头迎击敌人。对方还派出了神机，在困境中《卡雷贾斯II》再临。
坐镇的是（大家以为已经死了的）奥利巴特皇子，船上还有总校毕业生、其他分校学生和帮手们。同时奥斯本也传来影像，因为开战日即将到来，让大家赶紧去准备《七大相剋》，大家四散离开。黎爷等人登上了卡雷贾斯II。
大家了解到皇子是因为作了二次手脚的乔治和怪盗布卢布兰的协助下才保住一命，当然托瓦尔和光剑也都健在。开战在即，大家决定去罗赛莉亚所在的《月灵窟》了解一些关键情报。与焰之圣兽状态下的罗赛莉亚战斗到最后，《月冥镜》启动。大家了解了《不死者》与地精连结、圣女莉安娜担忧的《暗》，还有奥斯本宰相是德莱凯尔斯大帝的转生，还有元凶《黑之骑神》伊修麦格。为了打倒《黑之骑神》，大家准备先战胜和其他骑神的相剋以取得力量。
前往路嘉和《紫》所在的龙灵窟，但是灵窟被结界封锁。七班解除障壁后再和路嘉战斗，完成《第二相剋》。
接着是圣女所在的星之灵场，同样又要处理障壁。同样利用演唱会引开卫士，这次是借助克州的彩虹剧团，舞蹈的姿势还是过于生硬，而且角色演出服都不搞一套，看来赶工赶得比较厉害。黎爷等人趁机潜入兰花塔中枢《魔导区块》，打败最上层的亚尔赛德子爵和马克邦，最后停下装置。
圣女本想亲自战胜七大相剋消灭《黑》。黎爷以战斗来回应圣女。战胜圣女后大家都希望能借助莉安娜的力量，莉安娜最终决定留到最后。但卢法斯突然闪现到灵场背刺了莉安娜，篡夺《银》的力量。莉安娜向众人说出自己的想法后结束了漫长的人生旅程。
摆个头盔在这让人还以为莉安娜被麻美了
这时帝国各地开始发生异变，空中出现了五根《盐桩》，帝都上空也出现了最终相剋的舞台《幻想机动要塞》。大家决定分头突袭盐桩解除结界，再由卡雷贾斯II冲进要塞。为了不留下遗憾，作战前夜大家在克州游乐园米修拉姆举行送行会。
9 月 1 号开战当天，《大地之龙》与《千之阳炎》作战计划启动。奥利巴特也宣布《翼之闪光》开始行动。艾丝蒂尔、洛伊德、安洁莉卡、逗巴莉和奥蕾莉亚将军分别率五支队伍攻略盐桩。最后卡雷贾斯II将七班送上要塞。
七班逐一击破众多的敌人。并和剩下的《绯》、《金》相剋胜利后，终于来到奥斯本宰相面前。另外《小丑》等人在也解释到《深渊》 的目的是为了利用内战来产生《斗气》，并让《灰》和《苍》在煌魔城战斗模拟《相剋》来《炼钢》，虽然后面失败了。因为结社的目的是“观察黄昏事态发展”，所以在后面也决定支持宰相阵营并和《深渊》分道扬镳。
最后战胜了宰相的黎爷被帝国诅咒伊修麦格所附身，但现如今它和《黑》的本体分离，显现在这个次元时，也是毁灭它的唯一机会。
一般结局中黎爷带着伊修麦格脱离了女神的世界。
真结局里由大地之兽亚尔古瑞丝的协助使《黑》对弗兰兹的控制减弱，黎爷从弗兰兹处获得了将伊修麦格分离的办法。被分离出的伊修麦格被封在大地之栏内，本体终于显现出来，接着就被史上最大的 boss 团围殴致死。
最后骑神们还赠送了还魂大礼包，把克洛和米莉亚姆复活了（现在是把米莉亚姆固魂在剑上，之后再转移到弗兰兹事先在工房制作的备用身体上）。
再读一次打完伊修麦格的存档还有一段隐藏剧情：一直神神秘秘的结社盟主终于出现，她表示我们正在有条不紊地向目标迈进，虽然躲过了这次《黄昏》，世界最后还是逃不过灭亡的命运。
全剧终。
轨迹系列我是从闪轨直接开始玩的，没有接触过前作，所以不像网友们表现那么有落差。而且也是一到四作一起通的，整个体验相对连贯（面对分割商法还是要养肥了再看）。我觉得闪轨整个故事总得来说还是挺完整的，该有的伏笔也都解释得差不多了。主线看下来会有模式化的东西，比如一三作的《破》和二四作的《立》，都是捞队友然后逐个推塔。不过细看到一些支线任务时会发现里面情节的描述还是挺丰满的，每个 NPC 都有自己的故事。还有七班其他人的羁绊事件等，如果不搞什么好感系统，他们的羁绊事件大可以改成支线事件，更加详细地展开一番。我记得第四作断章里亚尔缇娜有个修复黎恩损坏项链的任务，这就让主线中仅仅是说说台词的关心得到很好的表达，能体会到身为人造人的黑兔正在慢慢变得富有感情。剧情发展中也会不断提到角色们的个人成长，特别是旧七班毕业后一年间各自都变得更强大了。
劳拉的觉察
克蕾雅的过去
第四作里真的一起去了
不过想吐槽的东西还是集中在剧本方面。从剧情概要里也可以看出，经常会把“大事件”简化成和家人、老对手间的“小矛盾”，四大贵族挑起的全国性质的内战，怎么父女打一架就说完事？下手的将士还不闹翻了，然而只字未提。相比之下第四作里的艾伦受《黄昏》影响散发出的攻击性这段就比较实在，写了士兵的好战之心。同样七班在全国范围的活动里凭借着关系户的身份开了不知道多少后门，格局还是没有打开，又是走回到几个熟人之间互动的套路。
克洛那一把赚够了眼泪，不过后面类似的桥段就不太好用了，像奥瓜还是空轨出场的元老级角色，想要领便当还是有点难度。后面安洁莉卡自不用说，连最后克洛和米莉亚姆居然也都排除万难复活了，没有人死去的美好世界就完成了。
另外黎恩追了克洛整个系列，本来就是被一个不太熟的学长骗个 50 米拉，突然就熟络起来，还要“抓你回来毕业”？牛皮糖属性跟其他女主们莫名粘着黎爷完全一致，金毛败犬亚莉莎看了都直摇头，桃乐丝看了已经失血过多而亡。克洛不愧是真女主，还有专属 bgm
三、四作里模型更新后人物漂亮了许多，特别是艾玛，模型越来越贴近立绘了，演出效果也自然了很多。不过还是因为人物太多，碰到大场面时画面会卡一卡。
游戏性上应该还是不难，虽说要我一周目噩梦还是要吐血，二周目割草不香吗。后面核心回路收集好后就有不少实用组合出来了，红莲霸道或者金牛霸道，何况霸道在三、四还能合成。不过通常还是会带回 cp 回 ep 的刷图回路。第二作的增幅强化也很爆炸，直接三连。三、四引入勇气指令后物理系第位又上升了，毕竟魔法打不出 bp。不过到第四作里又把破防削了，第三作打出的破防硬直够我输出好久，第四作经常就是 boss 被破防下回合马上就能行动，完全破了个寂寞，不如直接指令加必杀率来堆《闪》。另外高难度下想打出失衡也难了很多，bp 常常会断供。
角色太多，要不是强制上场，真就可以一直坐冷板凳。每人配一套回路也麻烦。另外因为人老是被剧情换来换去，导致带《月镜》的人被换走，小地图看不到宝箱血亏。
要素收集……后面算是被虐习惯了，第四作多显示了战斗信息收集完的小勾，小地图也能显示更多提示了，这些小细节挺好。宝箱也能按地图列出数量就好了，省得成天战战兢兢的。至于小游戏……卡牌场数太多；波姆碰的难度真是莫名其妙，难的关难到我想砸手柄，也有明明很难的对手，打着打着他自己爆了……
音乐上前两作听着还是挺合口味的，到后两作就变平淡了，甚至很多一听就是《blue destination》的 remix，有点审美疲劳，当然这不影响《blue destination》是最佳 bgm。
声优有不少大牌，不过印象深刻的还属逗巴莉，表现过于优秀，也可能跟角色的遣词造句有关。反过来像爱丽榭配起来就比较怪异，声线没有起伏，而且经常在不自然的地方停顿，听着比较别扭。
亚尔缇娜一针见血
